How to Effectively Perform Advanced Single-Cell Cell-Type Predictions

El próximo 13 de febrero BioBam organiza un webinar para investigadores interesados en mejorar la predicción de tipos celulares en datos de scRNA-Seq. Con la integración de CellKb en la plataforma bioinformática OmicsBox, ahora es posible agilizar la anotación utilizando múltiples referencias y permitiendo anotaciones cross-especies, sin necesidad de curar referencias manualmente.

La predicción de tipos celulares es uno de los pasos más difíciles en el análisis de secuenciación de Single-Cell ARN (scRNA-Seq), y a menudo requiere contar con referencias ya anotadas. Encontrar las referencias adecuadas consume mucho tiempo y la precisión puede verse comprometida al depender de una sola fuente de datos.

En este webinar presentamos la solución a este reto: gracias a OmicsBox, la plataforma bioinformática de BioBam ahora mejorada con CellKb. Esta innovadora herramienta agiliza la anotación de datos scRNA-Seq aprovechando simultáneamente múltiples referencias, permitiendo la anotación cross-especies y actualizándose continuamente. Todo ello sin necesidad de que los investigadores elaboren sus propias referencias.

Agenda del webinar:

Introducción a OmicsBox 3.4: Descubre cómo la última versión de OmicsBox facilita el acceso a la bioinformática avanzada para cualquier investigador sin importar su nivel de experiencia.

Visión general del análisis Single-Cell ARN-seq: Conoce al detalle el workflow y los retos asociados a la predicción de tipos celulares, en particular la selección de referencias.

Sobre CellKb: Descubre cómo CellKb supera las limitaciones de la anotación tradicional basada en referencias gracias a sus funciones avanzadas.

Demostración en directo: OmicsBox en acción y al detalle; incluida su integración con CellKb. Exploraremos los resultados interactivos de la agrupación, las visualizaciones y las herramientas de anotación.

Sesión de Preguntas y Respuestas: Nuestro equipo resolverá todas las dudas de los asistentes en directo.

Realizaremos dos sesiones: 9:30 y 18:30 CET. ¡Inscríbete a la que mejor se adapte a tu horario!

Ponentes:

  • Marta Benegas, Bioinformática, Experta en Single-Cell.
  • Ashwini Patil, PhD., CEO de Combinatics.
  • Dr. Stefan Götz, CEO de BioBam

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