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La actividad de ProtoQSAR consiste en el desarrollo y aplicación de métodos computacionales para la evaluación de las propiedades físico-químicas, biológicas y/o (eco)toxicológicas de compuestos químicos, de origen natural o sintético, lo que nos permiten trabajar en un entorno “virtual”, que presenta numerosas ventajas frente a los ensayos de laboratorio tradicionales, entre las que destacan la rapidez de obtención de resultados ( nuestros métodos reducen el tiempo necesario en comparación con los ensayos in vitro e in vivo), el ahorro de recursos materiales y económicos, ya que se evitan los costes asociados a la experimentación, y el cumplimiento riguroso de nuestros métodos con las reglas establecidas para su validación y aceptación, garantizando así su aplicabilidad a nivel regulatorio
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